Wegener es miembro de diversas comisiones especializadas y de control, y presidente de una de las dos grandes asociaciones de la industria farmacéutica alemana.
Respecto al uso de células madre embrionarias, Wegener advierte que «en el debate acerca de la experimentación con destrucción de embriones se difunden muchas tesis no verificadas. Sin embargo, hasta ahora no se ha demostrado en ninguna parte, ni siquiera como punto de partida, que al menos en los próximos diez años se pueda desarrollar un fármaco a partir de la experimentación con células madre embrionarias».
Wegener es partidario de continuar la experimentación en el campo de las células madre adultas.
