El obispo electo nació en Madrid el 31 de julio de 1949. Realizó los estudios eclesiásticos en el Seminario Mayor de Madrid-Alcalá. Es Licenciado en Teología Bíblica por la Pontificia Universidad de Comillas.
El futuro obispo fue ordenado sacerdote el 19 de marzo de 1975 para la diócesis de Madrid-Alcalá y destinado a la parroquia de S. Jorge mártir de Córdoba de la que fue primero Vicario parroquial, de 1975 a 1983; después Vicario parroquial regente, de 1983 a 1985; y Párroco, de 1985 a 1991.
Este último año se erigió la diócesis de Getafe y desde entonces Rafael Zornoza Boy ha desarrollado su ministerio sacerdotal en esta sede episcopal.
Fue el secretario particular del primer Obispo de Getafe, monseñor Francisco-José Pérez y Fernández-Golfín, hasta su fallecimiento en el año 2004. Además, desde su fundación, en 1994, es el Rector del Seminario Diocesano Nuestra Señora de los Apóstoles. Es miembro del Consejo Presbiteral y del Colegio de Consultores y confesor ordinario del Carmelo de La Aldehuela.
