Como vicepresidente ha sido elegido monseñor Alberto Suárez Inda, arzobispo de Morelia; como secretario general; monseñor José Leopoldo González González, obispo auxiliar de Guadalajara, y como tesorero, monseñor Alonso Garza Treviño, obispo de Piedras Negras.
En una entrevista colectiva tras su elección, monseñor Aguiar Retes consideró que uno de los objetivos de su presidencia será el de llevar a la práctica «el proyecto de la reestructuración» de la Conferencia, que ha culminado con la asamblea que mañana se clausurará, en el que él mismo ha trabajado en los tres últimos años.
El nuevo presidente explica que «como Conferencia Episcopal, sabemos del momento tan complejo que vive nuestro país y la Iglesia siempre será una instancia de colaboración en vista de lograr el bien del país en su conjunto».
Monseñor Aguiar Retes, de 56 años, terminó sus estudios de Humanidades y Filosofía en el Seminario de Tepic (1961-1969), y los estudios de Teología en el Seminario de Montezuma, Estados Unidos (1969- 1972) y el Seminario de Tula, Hidalgo (1972-1973).
Fue ordenado Sacerdote en la Catedral de Tepic, Nayarit, el 22 de abril de 1973. Después de su ordenación sacerdotal fue enviado a Roma como alumno del Pontificio Colegio Latinoamericano y consiguió la Licenciatura en Sagrada Escritura en el Pontificio Instituto Bíblico de Roma (1974-1977).
De 1978 a 1991, fue rector del Seminario de Tepic. Durante el tiempo que fue rector, también fue presidente de la Organización de Seminarios Mexicanos (OSMEX) de 1986 a 1990. En 1991 regresó a Roma y el 7 de junio de 1996 obtuvo el Doctorado en Teología Bíblica en la Pontificia Universidad Gregoriana.
De 1992 a 1993 formó parte de un equipo de biblistas que prepararon la edición de la Biblia de América.
Entre 1996 y 1997 fue profesor de la Sagrada Escritura en la Pontificia Universidad de México y rector de la residencia «Juan XXIII» para sacerdotes de la misma universidad. Es nombrado tercer obispo de Texcoco el 28 de mayo de 1997 y consagrado obispo el 29 de junio del mismo año.
El 25 de mayo del 2000 fue nombrado secretario general del Consejo Episcopal Latinoamericano (CELAM) y el 15 de mayo de 2003 vicepresidente primero.
