Sucede al arzobispo Juan Ignacio Larrea Holguín, cuya renuncia al gobierno pastoral de la archidiócesis fue aceptada por límite de edad.
Monseñor Antonio Arregui Yarza nació en Oñate, diócesis de San Sebastián (España), el 3 de junio de 1939.
Cursó los estudiosos eclesiásticos de Filosofía y Teología en el «Studium» General de la Prelatura Personal del Opus Dei, en España, en el Seminario de la misma Prelatura en Roma, y en la Universidad de Navarra.
Se doctoró en Derecho Canónico en la Universidad Pontificia de Santo Tomás («Angelicum») de Roma y en Leyes en la Universidad de Navarra.
Fue ordenado sacerdote el 19 de marzo de 1964 como miembro de la Prelatura del Opus Dei. En 1965, llegó a Ecuador donde fue capellán de diferentes instituciones escolares, profesor ordinario de Deerecho público eclesiástico en la Pontificia Universidad Católica de Ecuador, vicario regional del Opus Dei, secretario general adjunto de la Conferencia Episcopal Ecuatoriana, y director de «Radio Católica Nacional».
El 4 de enero de 19990 fue nombrado obispo auxiliar de Quito. El 25 de julio de 1995 fue transferido a la diócesis de Ibarra.
Desde 1993 a 1999 desempeñó el cargo de secretario general de la Conferencia Episcopal Ecuatoriana y en 1999 fue elegido vicepresidente de la misma Conferencia Episcopal y presidente del Departamento de Comunicaciones Sociales del CELAM. Entre 2001 y 2002 fue también administrador apostólico de Tulcán.
La diócesis de Guayaquil tiene una población de 3.600.000 habitantes de los cuales 3.400.000 son católicos.
