De entre ellos, las asociaciones de bioética, de modo particular la prestigiosa AEBI (Asociación Española de Bioética), se han posicionado mayormente en contra.
Algunas de las asociaciones llamadas a consulta, SAIB (Sociedad Andaluza de Investigación Bioética), Foro Vital, ANDOC (Asociación para la Defensa de la Objeción de Conciencia del personal biosanitario), las plataformas HayAlternativas y HazteOir, han realizado posteriormente una convocatoria a los medios en la que han reiterado su postura contraria a la investigación con embriones sobrantes de la fecundación in vitro.
Para José Miguel Serrano, portavoz ante el Parlamento de HayAlternativas, la iniciativa, actualmente en trámite parlamentario, es «inoportuna, ilegal y oportunista, entre otras cosas, porque supone una violación de la actual ley de fecundación in vitro de 1988, y porque el Parlamento andaluz no tiene potestad para legislar en ese campo. Supone rebajar aún más el estatuto del embrión humano».
Estas asociaciones ya manifestaron su oposición ante el proyecto de ley cuando ésta fue admitida a trámite el pasado 12 de marzo, ya que según el comunicado hecho público ese día por HazteOir, ese proyecto de ley «vulnera la Ley de Reproducción Humana Asistida, que en ningún caso autoriza el uso de embriones congelados sobrantes de los procesos de fecundación asistida (FIV) como materia prima para la investigación».
